Ti serve il cd di Win ME... cmq ti consiglio di passare a XP o al massimo a 2000, perchè ME è pieno di bug (non che Xp non ne abbia, ma ne ha molti meno!)
Configuri il BIOS per bootare di default prima il lettore CD, poi resetti e parti col CD di Windows inserito. A quel punto da CD scegli la partizione dove installare il S.O., formatti l'installazione esistente e reinstalli. Quando hai finito l'installazione formatta tutti gli eventuali altri dischi o partizioni.
Se no puoi sempre ricorrere a Fdisk, ma ne vale la pena?