Me lo sono chiesto anch'io tempo fa. Secondo me potrebbero esserci 3 problemi.
1. La polvere che è più pesante e che tende a depositarsi andando verso il basso riempirebbe più facilmente il dissi;
2. I flussi d'aria sarebbero peggiorati, dato che il flusso ideale è quello dal davanti verso il dietro, dal basso verso l'alto (dato che il calore va verso l'alto);
3. Legato al punto due. Dato che il calore va verso l'alto è molto più semplice spingerlo nella sua direzione naturale, che spingerlo verso il basso (come dovrebbe fare la ventola se le schede video fossero fatte al contrario...).
Poi magari ho sparato solo cazzate, però secondo me i motivi sono circa questi... Niente è fatto a caso comunque...