1) Per rendere carino l'alimentatore e soprattutto più sistemato, aumentando il flusso d'aria puoi sleevare i cavi. Potresti acquistare il "Vantec Cable Sleeving Kit" del colore che desideri e un estrattore di pin. La procedura di sleeving però è molto lunga in quanto devi estrarre tutti i pin dai connettori di alimentazione per infilare i cavi nelle guaine, inserire il termorestringente, reinserire i pin nei connettori e scaldare il termorestringente per farlo restringere...
2) Non ho visto i case, ma preferisco quello che ho in sign
1) Non dovrebbero esserci problemi, per sicurezza, vai nel sito ufficiale di Zalman e verifica la lista di compatibilità.
2) La CPU va overcloccata da Windows soltanto quando si vuole benchare. Un solido overclock va praticato sempre da bios. Inoltre non è detto che le proprie componenti siano supportate da programmi come Clockgen... Per quanto riguarda i settaggi, leggi il thread in top e poni li le domande.
3) Ovviamente sono integrati. Nelle specifiche della motherboard (non nel manuale) trovi i componenti e il ruolo che svolgono. Potresti richiedere il datasheet all'Asus, non dovrebbero avere problemi a inviartelo, ma non credo ti interessi...
4) Speedfan, Motherboard Monitor, Probe (solo per Asus). Per linux dovrebbero esistere in quanto spesso i programmi si basano su engine di detection che sono open source. Sicuramente qualcuno avrà implementato software del genere anche per linux...
5) Agp fast write e aperture size sono opzioni che non portano migliorie significative, anzi talvolta portano problemi di compatibilità. Se non hai problemi tieni il primo attivo e il secondo al doppio della memoria della scheda video.