Mmm di solito il cambio di processore non implica il format, quindi non credo cghe risolveresti, ma magari puoi provare.
Più che altro, sei sicuro che quando hai montato il Q9550 i valori da bios erano tutti settati su *auto*, o magari c'era qualche personalizzazione fatta per il Q6600? Anche se, non ne sono certo (non ci ho mai fatto caso), al cambio di processore il bios si resetta da solo.
Magari prova a rimontarlo, metti per bene la pasta e controlla da bios voltaggi e roba varia se sono in regola