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Versus XIII fu presentato nell'ormai lontano E3 2006 come uno dei titoli facenti parte della Fabula Nova Crystallis, la saga a cui in origine appartenevano FF13 e Agito (poi rinominato FF Type 0). FNC non va vista come un'ambientazione comune o una storia che leghi titoli diversi, ma come un universo con più mondi che condividono alcuni riferimenti mitologici e tematici. A rimarcare le sue peculiarità, Versus fin dall'annuncio prese una direzione diversa rispetto ai FF numerati per via del gameplay da action-jrpg vicino alle cifre di KH (il team di sviluppo del resto era quello dei KH numerati) e dell'ambientazione a metà fra una contemporaneità riletta secondo l'estetica nomuriana ed elementi fantasy, steampunk e sci-fi.
Dato l'estremo ritardo nello sviluppo (forse dovuto alla necessità di spostare personale sul rilancio di FF14, al di là del trend negativo di Square Enix in merito al rispetto delle tempistiche) continuare a chiamarlo Versus XIII rischiava di essere controproducente, dato che uno spin-off normalmente attira meno interesse rispetto a un capitolo numerato e che, a dispetto del titolo, Versus fin dall'inizio non aveva legami narrativi rilevanti con 13 e, mantenendo quel numero nel titolo, avrebbe potuto allontanare chi era rimasto deluso da FF13 e relativi seguiti.