Sì, tutti gli Atelier salvo gli Iris e i Mana Khemia hanno limiti temporali di quel genere, anche se essi vengono esplicitati molto chiaramente dal gioco proprio per permettere al giocatore di gestire i giorni disponibili nel modo più proficuo. Non so quale finale tu ti fossi trovata di fronte, ma considera che i tre Atelier della trilogia di Arland sono assai aperti sotto il profilo narrativo e, per quanto contemplino un true ending con requisiti assai ostici, possono essere tranquillamente affrontati in modo più svagato puntando a uno dei molti finali minori.
Forse essendo la tua prima esperienza con la serie ti sei trovata disorientata e hai finito per non riuscire a ottimizare le risorse scarse (reagenti e tempo, sostanzialmente) nel modo migliore, ma è probabile che tornandoci sopra le cose ti risultino molto più semplici
Un'altra opzione è puntare ad Atelier Ayesha, in uscita a marzo, che mantiene i limiti temporali ma dà all'intreccio un ruolo più rilevante, rendendo meno pesante l'enfasi delle componenti gestionali.