Se disabiliti la scheda integrata, e durante l'avvio il PC non trova nessuna VGA, è normale che dia errore.
Allora.
Hai per caso cambiato la voce "VGA Boot From" da AGP in PCI?
Con la prima, funzionano solo le schedevideo AGP, con la seconda solo PCI.
Hai per caso cambiato la voce "AGP Mode"? Da 4x a 1x?
Se l'hai messa ad 1x potresti aver bruciato la scheda video.
La scheda video integrata si riabilita solo attraverso il bios. Se non riesci ad entrare più nel bios, è un problema.
Prima, però, riavvia il PC con il monitor collegato alla scheda video integrata. Magari non l'hai disabilitata. ^^